일본 고등학생인 토키무네 마사카즈는 유머, 음모, 사랑이 뒤섞인 일상 생활에서 고군분투합니다.
그리 멀지 않은 미래에, 국가들은 식량 부족 문제를 해결하기 위해 과학 연구에 막대한 투자를 하게 될 것입니다. 이로 인해 119 너머의 새로운 원소가 발견됩니다. 도쿄의 과학자 아라키 히코쥬로는 무에서 생명을 생성할 수 있는 256번째 원소인 아라라기늄을 만듭니다. 그러나 첫 번째 실험에서 예상치 못한 사고로 아라라기늄이 도쿄 전역에 흩어집니다.
며칠 후, 기이한 현상이 일어난다: 죽은 것으로 여겨졌던 사람들이 죽기 전의 기억을 간직한 채 다시 나타난다. 아라라기 휴먼(Araragi Humans)이라고 불리는 이 인간은 사고 시점과 72시간 전 사이의 시간대에서 출현합니다.
이 이야기는 몇 년 후 도쿄에서 펼쳐집니다...